Μια τυπική θεραπεία εξωσωματικής γονιμοποίησης αποτελείται από διαφορετικά στάδια που αλληλοσυνδέονται και πρέπει να οργανωθούν πολύ προσεκτικά. Το αποτέλεσμα κάθε σταδίου θεωρείται σημείο αναφοράς επιτυχίας για το επόμενο στάδιο. Οι ωοθήκες διεγείρονται με τη σειρά τους και μετά τα αυγά συλλέγονται, συνδυάζονται με σπέρμα και μετατρέπονται σε έμβρυα έτοιμα για μεταφορά. Το έμβρυο ή τα έμβρυα, που είναι τώρα το τελευταίο στάδιο και έχουν το υψηλότερο δυναμικό εγκυμοσύνης, τοποθετούνται στην έτοιμη μήτρα με τη βοήθεια ενός ειδικού καθετήρα. Αυτή η διαδικασία, που ονομάζεται μεταφορά εμβρύου, είναι το πιο σημαντικό βήμα στη θεραπεία της εξωσωματικής γονιμοποίησης. Γενικά, προτιμάται η μεταφορά βλαστοκύστης, η οποία φθάνει κατά μέσο όρο 100 κύτταρα. Ανεξάρτητα από το πόσο υψηλής ποιότητας λαμβάνεται ένα έμβρυο, είναι το πιο σημαντικό κλειδί για μια επιτυχημένη θεραπεία να δημιουργηθεί ελάχιστο τραύμα στη μήτρα της μητέρας κατά τη διάρκεια της διαδικασίας, δηλαδή, χωρίς να διαταραχθεί το περιβάλλον στο οποίο το έμβρυο θα προσκολληθεί στη μήτρα ως όσο το δυνατόν περισσότερο.

Ο ασθενής πιέζεται στα ούρα πριν από τη μεταφορά εμβρύου. Έτσι, κατά τη διάρκεια της διαδικασίας, η πρόοδος του καθετήρα στη μήτρα μπορεί να ακολουθηθεί από ένα δεύτερο άτομο με κοιλιακό υπερηχογράφημα. Η μεταφορά του εμβρύου μπορεί να γίνει οποιαδήποτε μέρα από τη δεύτερη έως την πέμπτη ημέρα μετά τη γονιμοποίηση. Ο χρόνος μεταφοράς αποφασίζεται λαμβάνοντας υπόψη την ποιότητα του εμβρύου, τον αριθμό των αναπτυσσόμενων εμβρύων, την ηλικία του ασθενούς, εάν γίνεται γενετική διάγνωση. Εν τω μεταξύ, το έμβρυο ή τα έμβρυα που πρόκειται να μεταφερθούν ελέγχονται 4 ώρες νωρίτερα και προετοιμάζονται για μεταφορά.

Ο ασθενής μεταφέρεται στο χειρουργείο στο κέντρο εξωσωματικής γονιμοποίησης και προετοιμάζεται στο γυναικολογικό τραπέζι σαν να εξεταστεί. Εισάγεται κολπικό δείγμα. Η κολπική περιοχή και η εξωτερική περιοχή καθαρίζονται με τετράγωνα αέρια υγραμένα με αποστειρωμένο αλατόνερο. Οι εκκρίσεις, εάν υπάρχουν, αφαιρούνται από τον τράχηλο. Υπό την καθοδήγηση του υπερήχου, πρώτα, ανάλογα με την προτίμηση του ιατρού, η είσοδος στη μήτρα γίνεται με δοκιμαστικό καθετήρα. Έτσι, δοκιμάζεται εκ των προτέρων ότι η μεταφορά θα είναι δύσκολη ή εύκολη. Τώρα ο ασθενής, ο γιατρός και ο εμβρυολόγος είναι έτοιμοι για τη μεταφορά. Ο καθετήρας που περιέχει το έμβρυο κατευθύνεται αργά μέσω του τραχήλου προς τη μήτρα υπό καθοδήγηση υπερήχων από την κοιλιά και απελευθερώνεται αργά στη μήτρα. Στη συνέχεια, ο καθετήρας μεταφοράς αφαιρείται αργά και ελέγχεται για να διασφαλιστεί ότι το έμβρυο έχει απελευθερωθεί στη μήτρα. Όλες αυτές οι διαδικασίες διαρκούν 10-15 λεπτά, είναι ανώδυνες και δεν χορηγείται αναισθητικό στον ασθενή. Μετά τη διαδικασία, ο ασθενής τοποθετείται στην πλάτη του με τα γόνατά του λυγισμένα για 10 λεπτά. Στη συνέχεια, ο ασθενής μεταφέρεται στο κανονικό δωμάτιο και αποβάλλεται εντός 30-60 λεπτών. Συνιστάται να μην κάνετε βαριά δουλειά και να μην κάνετε σεξουαλική επαφή για 3 ημέρες. Διεξάγεται εξέταση εγκυμοσύνης αίματος 12 ημέρες μετά τη μεταφορά εμβρύου.